A terapia extracorpórea por ondas de choque deve ser prescrita por um ortopedista e tem como contra-indicação os seguintes itens:

- Paciente tendo anormalidade coagulativa (coagulopatia), ou que esteja tomando algum tipo de anticoagulante;

- Paciente estando grávida;

- Paciente com alto risco de algum tipo de anestesia ou analgesia usada;

- Infecção aguda de tecido mole ou osso;

- Infecções sistêmicas;

- Tecido pulmonar no foco;

- Tecidos parenquimatosos no foco;

- Tratamento no crânio, coluna vertebral e costelas;

- Vasos ou nervos maiores no foco;

- Polineuropatias (hipersensibilidade a dor);

- Doença primária maligna (tumores) na área de tratamento;

- Epífises no foco;

- Arritmias cardíacas ou uso de marca-passo;

- Epiliepsia.